Mikrotiterplatten sind standardisierte Platten mit vielen kleinen Vertiefungen (Wells), die in der Durchflusszytometrie zur Vorbereitung, Lagerung oder parallelen Bearbeitung mehrerer Proben genutzt werden. In jedem Well eine Probe. Typischerweise ist das 96 Well Format weit verbreitet.

Sie ermöglichen die automatische oder manuelle Überführung von Zellen und Reagenzien in den Durchflusszytometer, wodurch Hochdurchsatzmessungen effizient durchgeführt werden können. Durch ihr Rasterformat lassen sich Proben systematisch behandeln und analysieren, was Zeit spart und die Vergleichbarkeit erhöht.