Aneuploidie bezeichnet eine Abweichung von der normalen Chromosomenzahl eines Organismus, bei der einzelne Chromosomen fehlen oder zusätzlich vorhanden sind, ohne dass ganze Chromosomensätze verändert sind. Kommt sie in lebensfähigen Organismen zur Ausprägung, führt sie meist zu Entwicklungsstörungen, veränderter Fruchtbarkeit oder morphologischen Veränderungen.
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